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Ce musée abrite des collections d'histoire naturelle qui comptent parmi les plus riches de France. Réparties sur trois niveaux et présentées de façon vivante et attrayante, elles permettent de découvrir le monde des invertébrés (insectes, reptiles et poissons), avec un vivarium et des aquariums, les mammifères et les oiseaux, les grandes évolutions géologiques de la planète de l'ère primaire à la préhistoire et les milieux naturels solognots.