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Le muséum d’histoire naturelle d’Autun trouve son origine au début du 19ème siècle. Les collections alors constituées par la Société d’histoire naturelle et actuellement propriétés de la Ville d’Autun, sont d’une exceptionnelle qualité. Le Muséum gère dans ses réserves plus de 800.000 échantillons. Le bassin d'Autun est une référence (stratotype) dans l'histoire de la terre pour une période de l'ère primaire. Les fossiles conservés en collection au musée en sont le témoignage.